Wavelet-based restoration methods: application to 3D confocal microscopy images
- Others:
- Laboratoire d'Informatique Gaspard-Monge (LIGM) ; Université Paris-Est Marne-la-Vallée (UPEM)-École des Ponts ParisTech (ENPC)-ESIEE Paris-Fédération de Recherche Bézout-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Inverse problems in earth monitoring (ARIANA) ; Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM) ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Signal, Images et Systèmes (Laboratoire I3S - SIS) ; Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)
- Dimitri Van De Ville and Vivek K. Goyal and Manos Papadakis
Description
We propose in this paper an iterative algorithm for 3D confocal microcopy image restoration. The image quality is limited by the diffraction-limited nature of the optical system which causes blur and the reduced amount of light detected by the photomultiplier leading to a noise having Poisson statistics. Wavelets have proved to be very effective in image processing and have gained much popularity. Indeed, they allow to denoise efficiently images by applying a thresholding on coefficients. Moreover, they are used in algorithms as a regularization term and seem to be well adapted to preserve textures and small objects. In this work, we propose a 3D iterative wavelet-based algorithm and make some comparisons with state-of-the-art methods for restoration.
Abstract
International audience
Additional details
- URL
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00733457
- URN
- urn:oai:HAL:hal-00733457v1
- Origin repository
- UNICA