Published February 25, 2022
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Publication
Evaluación de biclusters mediante intra-fluctuaciones mínimas: un enfoque multi-objetivo
Description
Las técnicas de biclustering aplicadas a datos
de expresión génica persiguen la extracción de
subconjuntos de genes co-expresados frente a
subconjuntos de condiciones. Una de las medidas
usada más frecuentemente para cuantificar
la calidad de los biclusters es el residuo
cuadrático medio, la cual ha sido incorporada
en diferentes métodos produciendo resultados
satisfactorios. Sin embargo, el uso de esta medida
no garantiza encontrar cierto tipo de biclusters.
En este trabajo se propone una nueva
medida para solventar dicha deficiencia, basada
en el cálculo del area comprendida entre dos
curvas, construidas a partir de los valores de
expresión. Para poder comprobar la eficiencia
de la medida propuesta, ésta ha sido incorporada
como uno de los objetivos en un algoritmo
evolutivo multi-objetivo, confirmando los
resultados obtenidos la calidad de dicha medida.
Additional details
Identifiers
- URL
- https://idus.us.es/handle//11441/130239
- URN
- urn:oai:idus.us.es:11441/130239