Published December 2014
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Conference paper
Stability analysis of a reduced transcription-translation model of RNA polymerase
Contributors
Others:
- Biological control of artificial ecosystems (BIOCORE) ; Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV) ; Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM) ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Observatoire océanologique de Villefranche-sur-mer (OOVM) ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Inria d'Université Côte d'Azur (CRISAM) ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Modeling, simulation, measurement, and control of bacterial regulatory networks (IBIS) ; Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes [Grenoble] (LAPM) ; Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Inria de l'Université Grenoble Alpes ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut Jean Roget
Description
The aim of this paper is to analyse the dynamicalbehaviour of models of gene transcription-translation for thesynthesis of RNA polymerase in a cell, with a closed loopfrom the produced RNA polymerase (end-product) to thetranscription step (RNA polymerase is needed to transcribe itsown gene). Using monotone system theory we study a reducedversion of this model with two variables (mRNA and protein),and show that it has either a single globally stable trivialequilibrium in (0, 0), or has an unstable zero equilibrium anda globally stable positive one. This dynamical behaviour can berelated to biological observations on the bacterium Escherichiacoli.
Abstract
International audienceAdditional details
Identifiers
- URL
- https://inria.hal.science/hal-01091674
- URN
- urn:oai:HAL:hal-01091674v1
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- UNICA