Imaging and multi-omics datasets converge to define different neural progenitor origins for ATRT-SHH subgroups
- Creators
- Lobón-Iglesias, María-Jesús
- Andrianteranagna, Mamy
- Han, Zhi-Yan
- Chauvin, Céline
- Masliah-Planchon, Julien
- Manriquez, Valeria
- Tauziede-Espariat, Arnault
- Turczynski, Sandrina
- Bouarich-Bourimi, Rachida
- Frah, Magali
- Dufour, Christelle
- Blauwblomme, Thomas
- Cardoen, Liesbeth
- Pierron, Gaelle
- Maillot, Laetitia
- Guillemot, Delphine
- Reynaud, Stéphanie
- Bourneix, Christine
- Pouponnot, Célio
- Surdez, Didier
- Bohec, Mylene
- Baulande, Sylvain
- Delattre, Olivier
- Piaggio, Eliane
- Ayrault, Olivier
- Waterfall, Joshua
- Servant, Nicolas
- Beccaria, Kevin
- Dangouloff-Ros, Volodia
- Bourdeaut, Franck
- Others:
- Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe ; Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris) ; Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Centre de Bioinformatique (CBIO) ; Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris) ; Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)
- Unité de génétique et biologie des cancers (U830) ; Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Université Paris sciences et lettres (PSL)
- Centre de recherche Croissance et signalisation (UMR_S 845) ; Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Institut Curie [Paris]
- Département de Génétique [Institut Curie, Paris] (Unité de Pharmacogénomique) ; Institut Curie [Paris]
- Immunité et cancer (U932) ; Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- GHU Paris Psychiatrie et Neurosciences
- Institut du Cerveau = Paris Brain Institute (ICM) ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Département de cancérologie de l'enfant et de l'adolescent [Gustave Roussy] ; Institut Gustave Roussy (IGR)
- Service de neurologie pédiatrique [CHU Necker] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-CHU Necker - Enfants Malades [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
- Laboratoire International Associé Réponse des Organismes et Populations face au Stress Environnemental - Université Côte d'Azur - Centre Scientifique de Monaco (LIA ROPSE) ; Université Côte d'Azur - Centre Scientifique de Monaco
- Signalisation, radiobiologie et cancer ; Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Unité de génétique et biologie des cancers (U830) ; Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Universität Zürich [Zürich] = University of Zurich (UZH)
Description
Abstract Atypical teratoid rhabdoid tumors (ATRT) are divided into MYC, TYR and SHH subgroups, suggesting diverse lineages of origin. Here, we investigate the imaging of human ATRT at diagnosis and the precise anatomic origin of brain tumors in the Rosa26-Cre ERT2 ::Smarcb1 flox/flox model. This cross-species analysis points to an extra-cerebral origin for MYC tumors. Additionally, we clearly distinguish SHH ATRT emerging from the cerebellar anterior lobe (CAL) from those emerging from the basal ganglia (BG) and intra-ventricular (IV) regions. Molecular characteristics point to the midbrain-hindbrain boundary as the origin of CAL SHH ATRT, and to the ganglionic eminence as the origin of BG/IV SHH ATRT. Single-cell RNA sequencing on SHH ATRT supports these hypotheses. Trajectory analyses suggest that SMARCB1 loss induces a de-differentiation process mediated by repressors of the neuronal program such as REST , ID and the NOTCH pathway.
Abstract
International audience
Additional details
- URL
- https://hal.science/hal-04295076
- URN
- urn:oai:HAL:hal-04295076v1
- Origin repository
- UNICA