Published December 2018
| Version v1
Journal article
Whole-genome landscape of Medicago truncatula symbiotic genes
- Creators
- Pecrix, Yann
- Staton, S. Evan
- Sallet, Erika
- Lelandais-Brière, Christine
- Moreau, Sandra
- Carrere, Sebastien
- Blein, Thomas
- Jardinaud, Marie-Françoise
- Latrasse, David
- Zouine, Mohamed
- Zahm, Margot
- Kreplak, Jonathan
- Mayjonade, Baptiste
- Satge, Carine
- Perez, Magali
- Cauet, Stephane
- Marande, William
- Chantry-Darmon, Céline
- Lopez-Roques, Celine
- Bouchez, Olivier
- Bérard, Aurélie
- Debellé, Frederic
- Munos, Stephane
- Bendahmane, Abdelhafid
- Berges, Helene
- Niebel, Andreas
- Buitink, Julia
- Frugier, Florian
- Benhamed, Moussa
- Crespi, Martin
- Gouzy, Jerome
- Gamas, Pascal
- Others:
- Laboratoire des interactions plantes micro-organismes (LIPM) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- University of British Columbia
- Interactions plantes-microorganismes et santé végétale ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Institut des Sciences des Plantes de Paris-Saclay (IPS2 (UMR_9213 / UMR_1403)) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université d'Évry-Val-d'Essonne (UEVE)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Département de chirurgie ; CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque
- Génomique et Biotechnologie des Fruits (GBF) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École nationale supérieure agronomique de Toulouse [ENSAT]-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
- Agroécologie [Dijon] ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bourgogne (UB)-AgroSup Dijon - Institut National Supérieur des Sciences Agronomiques, de l'Alimentation et de l'Environnement-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
- Centre National de Ressources Génomiques Végétales (CNRGV) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Génétique Animale et Biologie Intégrative (GABI) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AgroParisTech
- Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique (GeT-PlaGe) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Plateforme Génome & Transcriptome (GET) ; Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)-Génopole Toulouse Midi-Pyrénées [Auzeville] (GENOTOUL) ; Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
- Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) ; Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) ; Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
- Etude du Polymorphisme des Génomes Végétaux (EPGV) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- INRA - Mathématiques et Informatique Appliquées (Unité MIAJ) ; Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
- Institut de Recherche en Horticulture et Semences (IRHS) ; Université d'Angers (UA)-Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)-INSTITUT AGRO Agrocampus Ouest ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
- ANR grants EPISYM (grant no. ANR-15-CE20-0002), NODCCAAT (no. ANR-15-CE20-0012), REGULEG (no. ANR-15-CE20-0001), the 'Laboratoire d'Excellence (LABEX)' TULIP (no. ANR-10-LABX-41), the LABEX Saclay Plant Sciences (SPS; no. ANR-10-LABX-40) and the European Research Council (no. ERC-SEXYPARTH), and we made use of data previously generated in the ANR SYMbiMICS (ANR-08-GENO-106) and the INRA SPE EPINOD projects. The sequencing platform was supported by France Génomique National infrastructure (grant no. ANR-10-INBS-09) and by the GET-PACBIO programme (Programme opérationnel FEDER-FSE MIDI-PYRENEES ET GARONNE 2014-2020).
- ANR-15-CE20-0002,EPISYM,Régulations épigénétiques dans le développement de nodules symbiotiques racinaires chez les légumineuses(2015)
- ANR-15-CE20-0012,NODCCAAT,Comprendre le mode d'action du facteur de transcription NF-YA1 spécifique de l'intearction symbiotique rhizobium-légumineuses chez Medicago truncatula(2015)
- ANR-15-CE20-0001,REGULEG,Identification des régulateurs participant à la plasticité d'adaptation des graines de légumineuses aux changements environnementaux(2015)
- ANR-11-IDEX-0002,UNITI,Université Fédérale de Toulouse(2011)
- ANR-10-LABX-0044,CEMAM,Center of Excellence in Multifunctional Architectured Materials(2010)
- ANR-08-GENM-0015,SYMbiMICS,Dissection moléculaire de l'interaction symbiotique rhizobium-légumineuse : une approche combinée de micro-dissection laser et de séquençage massif d?ESTs(2008)
- ANR-10-INBS-0009,France-Génomique,Organisation et montée en puissance d'une Infrastructure Nationale de Génomique(2010)
Description
This Whole Genome Shotgun project has been deposited at DDBJ/ENA/GenBank under the accession PSQE00000000.
Abstract
International audience
Additional details
- URL
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-02383693
- URN
- urn:oai:HAL:hal-02383693v1
- Origin repository
- UNICA