A conserved transcriptional program for MAIT cells across mammalian evolution
- Creators
- Bugaut, Helene
- El Morr, Yara
- Mestdagh, Martin
- Darbois, Aurelie
- A. Paiva, Rafael
- Salou, Marion
- Perrin, Laetitia
- Furstenheim, Mariela
- Du Halgouet, Anastasia
- Mutala, Linda
- Le Gac, Anne‐laure
- Arnaud, Manon
- El Marjou, Ahmed
- Guerin, Coralie
- Chaiyasitdhi, Atitheb
- Piquet, Julie
- Smadja, David M
- Cieslak, Agata
- Ryffel, Bernhard
- Maciulyte, Valdone
- Turner, James M. A.
- Bernardeau, Karine
- Montagutelli, Xavier
- Lantz, Olivier
- Legoux, Francois
- Others:
- Immunité et cancer (U932) ; Institut Curie [Paris]-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Institut Curie [Paris]
- Sorbonne Université (SU)
- Fondation Alain Carpentier - (Centre Médical International) [Paris] (FAC - CMI) ; Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP) ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)
- Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
- Structure Fédérative de Recherche Necker (SFR Necker - UMS 3633 / US24) ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)
- Université d'Orléans (UO)
- Immunologie et Neurogénétique Expérimentales et Moléculaires (INEM) ; Université d'Orléans (UO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- The Francis Crick Institute [London]
- Centre hospitalier universitaire de Nantes (CHU Nantes)
- Structure fédérative de recherche François Bonamy (Nantes Univ - SFR François Bonamy) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Nantes Université (Nantes Univ)
- Biological control of artificial ecosystems (BIOCORE) ; Inria Sophia Antipolis - Méditerranée (CRISAM) ; Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Laboratoire d'océanographie de Villefranche (LOV) ; Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV) ; Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de la Mer de Villefranche (IMEV) ; Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de Recherche pour l'Agriculture, l'Alimentation et l'Environnement (INRAE)
- Génétique de la souris - Mouse Genetics ; Institut Pasteur [Paris] (IP)-Université Paris Cité (UPCité)
- Institut de Génétique et Développement de Rennes (IGDR) ; Université de Rennes (UR)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes ( Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique )
- Novartis
- Wellcome Trust: CC2052
- H2020 European Research Council: ERC-2019-AdG-885435
- Francis Crick Institute
- Cancer Research UK: CC2052
- Agence Nationale de la Recherche: ANR-10-IDEX-0001-02
- Agence Nationale de la Recherche: ANR-16-CE15-0020-01
- Agence Nationale de la Recherche: ANR-19-CE15-0002-01
- Agence Nationale de la Recherche: ANR-10-INBS-0908
- Agence Nationale de la Recherche: ANR-10-EQPX-0003
- Agence Nationale de la Recherche: ANR-17-CE14-0002-02
- Agence Nationale de la Recherche: ANR-20-CE15-0028-01
- Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale
- Fondation pour la Recherche Médicale: SPF202209015773
- Institut Pasteur
- Société Française de Dermatologie et de Pathologie Sexuellement Transmissible
- Institut Curie
- Medical Research Council: CC2052
- H2020 European Research Council: CoG 647971
- ANR-20-CE15-0028,MAIT-repair,Mécanisme de la fonction de réparation tissulaire des lymphocytes MAIT(2020)
- ANR-10-IDEX-0001,PSL,Paris Sciences et Lettres(2010)
- ANR-16-CE15-0020,MAIT,Biologie des cellules MAIT in vivo en situation normale ou pathologique(2016)
- ANR-19-CE15-0002,MAIT,Lymphocytes T innés spécifiques de métabolites microbiens: développement thymique et interactions avec le microbiote in vivo(2019)
- ANR-10-EQPX-0003,ICGex,Equipement de biologie intégrative du cancer pour une médecine personnalisée(2010)
- ANR-17-CE14-0002,Diab1MAIT,Rôle des cellules MAIT dans le diabète de type 1 chez l'homme et la souris(2017)
Description
Mucosal-associated invariant T (MAIT) cells harbor evolutionarily conserved TCRs, suggesting important functions. As human and mouse MAIT functional programs appear distinct, the evolutionarily conserved MAIT functional features remain unidentified. Using species-specific tetramers coupled to single-cell RNA sequencing, we characterized MAIT cell development in six species spanning 110 million years of evolution. Cross-species analyses revealed conserved transcriptional events underlying MAIT cell maturation, marked by ZBTB16 induction in all species. MAIT cells in human, sheep, cattle, and opossum acquired a shared type-1/17 transcriptional program, reflecting ancestral features. This program was also acquired by human iNKT cells, indicating common differentiation for innate-like T cells. Distinct type-1 and type-17 MAIT subsets developed in rodents, including pet mice and genetically diverse mouse strains. However, MAIT cells further matured in mouse intestines to acquire a remarkably conserved program characterized by concomitant expression of type-1, type-17, cytotoxicity, and tissue-repair genes. Altogether, the study provides a unifying view of the transcriptional features of innate-like T cells across evolution.
Abstract
International audience
Additional details
- URL
- https://hal.science/hal-04386054
- URN
- urn:oai:HAL:hal-04386054v1
- Origin repository
- UNICA