Statistical region based active contour using a fractional entropy descriptor: Application to nuclei cell segmentation in confocal microscopy images
- Others:
- ICI ; Equipes Traitement de l'Information et Systèmes (ETIS - UMR 8051) ; Ecole Nationale Supérieure de l'Electronique et de ses Applications (ENSEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY)-Ecole Nationale Supérieure de l'Electronique et de ses Applications (ENSEA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-CY Cergy Paris Université (CY)
- Advanced Digital and Signal Image Processing Group (ADSIP) ; University of Central Lancashire [Preston] (UCLAN)
- Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe KEIA ; Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems (Laboratoire I3S - SPARKS) ; Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)
- General Engineering Research Institute (GERI) ; Liverpool John Moore University
- Equipe de recherche sur les relations matrice extracellulaire-cellules (ERRMECe) ; Fédération INSTITUT DES MATÉRIAUX DE CERGY-PONTOISE (I-MAT) ; Université de Cergy Pontoise (UCP) ; Université Paris-Seine-Université Paris-Seine-Université de Cergy Pontoise (UCP) ; Université Paris-Seine-Université Paris-Seine
- TERAFS project
Description
We propose an unsupervised statistical region based active contour approach integrating an original fractional entropy measure for image segmentation with a particular application to single channel actin tagged fluorescence confocal microscopy image segmentation. Following description of statistical based active contour segmentation and the mathematical definition of the proposed fractional entropy descriptor, we demonstrate comparative segmentation results between the proposed approach and standard Shannon's entropy on synthetic and natural images. We also show that the proposed unsupervised statistical based approach, integrating the fractional entropy measure, leads to very satisfactory segmentation of the cell nuclei from which shape characterization can be calculated.
Abstract
International audience
Additional details
- URL
- https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00817583
- URN
- urn:oai:HAL:hal-00817583v1
- Origin repository
- UNICA