Spade: Algoritmo Evolutivo para Descubrir Patrones de Desplazamiento en Microarrays

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El interés por extraer conocimiento útil de datos de expresión genómica ha experimentado un enorme auge en los últimos años con el desarrollo de los microarrays. Las técnicas de biclustering son aplicadas para obtener subconjuntos de genes que se expresen de manera similar frente a determinadas condiciones en un microarray. Una manera de medir la calidad de un bicluster es detectando si los genes que contiene siguen una tendencia similar, representada por un patrón. En este artículo se aborda este problema mediante computación evolutiva, presentando un algoritmo, llamado Spade, para la extracción de patrones de desplazamiento en biclusters. Los resultados empíricos obtenidos por Spade muestra la calidad de nuestra propuesta.

Abstract

Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT) TIN2004–00159

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Comisión Interministerial de Ciencia y Tecnología (CICYT) TIN2004-06689C0303

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