GWAS in the SIGNAL/PHARE clinical cohort restricts the association between the FGFR2 locus and estrogen receptor status to HER2-negative breast cancer patients
- Creators
- Cox, David
- Curtit, Elsa
- Romieu, Gilles
- Fumoleau, Pierre
- Rios, Maria
- Bonnefoi, Hervé
- Bachelot, Thomas
- Soulié, Patrick
- Jouannaud, Christelle
- Bourgeois, Hugues
- Petit, Thierry
- Tennevet, Isabelle
- Assouline, David
- Mathieu, Marie-Christine
- Jacquin, Jean-Philippe
- Lavau-Denes, Sandrine
- Darut-Jouve, Ariane
- Ferrero, Jean-Marc
- Tarpin, Carole
- Lévy, Christelle
- Delecroix, Valérie
- Trillet-Lenoir, Véronique
- Cojocarasu, Oana
- Meunier, Jérôme
- Pierga, Jean-Yves
- Faure-Mercier, Céline
- Blanché, Hélène
- Sahbatou, Mourad
- Boland, Anne
- Bacq, Delphine
- Besse, Céline
- Deleuze, Jean-François
- Pauporté, Iris
- Thomas, Gilles
- Pivot, Xavier
- Others:
- Centre de Recherche en Cancérologie de Lyon (UNICANCER/CRCL) ; Centre Léon Bérard [Lyon]-Université Claude Bernard Lyon 1 (UCBL) ; Université de Lyon-Université de Lyon-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Service d'Oncologie Médicale [CHRU Besançon] ; Centre Hospitalier Régional Universitaire de Besançon (CHRU Besançon)-Université de Franche-Comté (UFC) ; Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)-Université Bourgogne Franche-Comté [COMUE] (UBFC)
- Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier (IRCM - U1194 Inserm - UM) ; CRLCC Val d'Aurelle - Paul Lamarque-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)
- Centre Régional de Lutte contre le cancer Georges-François Leclerc [Dijon] (UNICANCER/CRLCC-CGFL) ; UNICANCER
- Institut de Cancérologie de Lorraine - Alexis Vautrin [Nancy] (UNICANCER/ICL) ; UNICANCER
- Validation et identification de nouvelles cibles en oncologie (VINCO) ; Institut Bergonié [Bordeaux] ; UNICANCER-UNICANCER-Université Bordeaux Segalen - Bordeaux 2-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Centre Léon Bérard [Lyon]
- Institut de Cancérologie de l'Ouest [Angers/Nantes] (UNICANCER/ICO) ; UNICANCER
- Institut Jean Godinot [Reims] ; UNICANCER
- Service d'Oncologie médicale [Clinique Victor Hugo] ; Clinique Victor Hugo
- Centre Paul Strauss ; CRLCC Paul Strauss
- Centre de Lutte Contre le Cancer Henri Becquerel Normandie Rouen (CLCC Henri Becquerel)
- Institut Daniel Hollard
- Institut Gustave Roussy (IGR)
- Institut de Cancérologie Lucien Neuwirth ; CHU Saint-Etienne
- CHU Limoges
- Clinique Drévon
- Centre de Lutte contre le Cancer Antoine Lacassagne [Nice] (UNICANCER/CAL) ; UNICANCER-Université Côte d'Azur (UCA)
- Centre de Recherche en Cancérologie de Marseille (CRCM) ; Aix Marseille Université (AMU)-Institut Paoli-Calmettes ; Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Fédération nationale des Centres de lutte contre le Cancer (FNCLCC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Service d'Oncologie médicale [CHU Caen] ; CHU Caen ; Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)-Normandie Université (NU)-Tumorothèque de Caen Basse-Normandie (TCBN)
- Laboratoire Bordelais de Recherche en Informatique (LaBRI) ; Université de Bordeaux (UB)-École Nationale Supérieure d'Électronique, Informatique et Radiocommunications de Bordeaux (ENSEIRB)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Pôle Mutualiste, Service Oncologie Médicale ; Delft University of Technology (TU Delft)
- Centre Hospitalier Lyon Sud [CHU - HCL] (CHLS) ; Hospices Civils de Lyon (HCL)
- Centre Hospitalier Le Mans (CH Le Mans)
- Centre Hospitalier Régional d'Orléans (CHRO)
- Institut Curie [Paris]
- Institut National du Cancer ; INCA
- Fondation Jean Dausset CEPH
- Centre National de Génotypage (CNG) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
- Synergie Lyon Cancer [Lyon] ; Centre Léon Bérard [Lyon]
Description
Genetic polymorphisms are associated with breast cancer risk. Clinical and epidemiological observations suggest that clinical characteristics of breast cancer, such as estrogen receptor or HER2 status, are also influenced by hereditary factors. To identify genetic variants associated with pathological characteristics of breast cancer patients, a Genome Wide Association Study was performed in a cohort of 9365 women from the French nationwide SIGNAL/PHARE studies (NCT00381901/RECF1098). Strong association between the FGFR2 locus and ER status of breast cancer patients was observed (ER-positive n=6211, ER-negative n=2516; rs3135718 OR=1.34 p=5.46x10-12). This association was limited to patients with HER2-negative tumors (ER-positive n=4267, ER-negative n=1185; rs3135724 OR=1.85 p=1.16x10-11). The FGFR2 locus is known to be associated with breast cancer risk. This study provides sound evidence for an association between variants in the FGFR2 locus and ER status among breast cancer patients, particularly among patients with HER2-negative disease. This refinement of the association between FGFR2 variants and ER-status to HER2-negative disease provides novel insight to potential biological and clinical influence of genetic polymorphisms on breast tumors.
Abstract
International audience
Additional details
- URL
- https://hal.science/hal-01391480
- URN
- urn:oai:HAL:hal-01391480v1
- Origin repository
- UNICA