Exploration of associations between phospholipase A2 gene family polymorphisms and AIDS progression using the SNPlex method.

Creators: Limou, Sophie; Coulonges, Cédric; Foglio, Mario; Heath, Simon; Diop, Gora; Leclerc, Sigrid; Hirtzig, Thomas; Spadoni, Jean-Louis; Therwath, Amu; Lambeau, Gérard; Gut, Ivo; Zagury, Jean-François

Others:: Centre National de Génotypage (CNG) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA); Institut Mondor de recherche biomédicale (IMRB) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université Paris-Est Créteil Val-de-Marne - Paris 12 (UPEC UP12); Chaire de Bioinformatique ; Conservatoire National des Arts et Métiers [CNAM] (CNAM) ; HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM)-HESAM Université - Communauté d'universités et d'établissements Hautes écoles Sorbonne Arts et métiers université (HESAM); Laboratoire d'Oncologie Moléculaire ; Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7); Institut de pharmacologie moléculaire et cellulaire (IPMC) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); ACV Development Foundation and Neovacs SA, Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Association pour la Recherche sur le Cancer (ARC), French Ministry of Education, Technology and Research

Description

Members of the secreted phospholipase A2 (PLA2) protein family can inhibit HIV-1 virus replication in vitro. To evaluate the impact of PLA2 gene polymorphisms on AIDS disease development, we studied 12 family members using SNPlextrade mark technology that permitted simultaneous typing of 70 tagging Single Nucleotide Polymorphisms (tagSNPs). The study utilized HIV-1 seropositive donors with slow progressor (n=168) or rapid progressor (n=54) status, plus 355 control subjects. All donors were Caucasian (total 577 individuals). Genetic associations yielded mainly 0.01

Exploration of associations between phospholipase A2 gene family polymorphisms and AIDS progression using the SNPlex method.

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