Published January 16, 2019
| Version v1
Publication
Caractérisation phénotypique et génomique des patients Becker avec délétion des exons 45-55
Creators
- Gargaun, Elena
- Yaou, Rabah Ben
- Solé, Guilhem
- Tiffreau, Vincent
- Laforet, Pascale
- Parent, Michel
- Bassez, Guillaume
- Stojkovic, Tanya
- Vanhulle, Catherine
- Servais, Laurent
- Lacombe, Pascal
- Pedespan, Jean-Michel
- Kettaneh, Adrien
- Roche, Corinne
- Gaillard, Dominique
- Sacconi, Sabrina
- Faivre, Laurence
- Nadaj-Pakleza, Alexandra
- Vallat, Jean Michel
- Laroche, Cécile
- Moing, Anne-Gaëlle Le
- Durigneux, Julien
- Themar-Noel, Christine
- Negrier, Marie Laure
- Espil-Taris, Caroline
- Boucher, Elise
- Delaubier, Anne
- Guillou, Claire
- Cuisset, Jean Marie
- Urtizberea, Andoni
- Eymard, Bruno
- Boland, Anne
- Deleuze, Jean François
- Salgado, David
- Khran, Martin
- Levy, Nicolas
- Blesius, Alexia
- Leturcq, France
- Pietri-Rouxel, France
Contributors
Others:
- Centre de recherche en Myologie – U974 SU-INSERM ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)
- CHU Bordeaux [Bordeaux]
- Activité Physique, Muscle, Santé (EA4488) ; Université de Lille, Droit et Santé
- Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)
- Centre de référence des maladies rares neuromusculaires [CHU Pitié-Salpétriêre] ; CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
- Institut de Myologie ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- CHU Pitié-Salpêtrière [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Sorbonne Université (SU)
- Service de pédiatrie néonatale et réanimation - neuropédiatrie [CHU Rouen] ; Hôpital Charles Nicolle [Rouen] ; CHU Rouen ; Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-CHU Rouen ; Normandie Université (NU)-Normandie Université (NU)-Université de Rouen Normandie (UNIROUEN) ; Normandie Université (NU)
- Service of Clinical Trials and Databases ; Institut de Myologie ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
- Université de Bordeaux Ségalen [Bordeaux 2]
- Recherche en épidémiologie et biostatistique ; Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Service de Neurologie [Vichy] ; CH Vichy
- Service de Génétique ; Centre Hospitalier Universitaire de Reims (CHU Reims)-Hôpital Maison Blanche-IFR 53 ; Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)-Université de Reims Champagne-Ardenne (URCA)
- CHU Nice ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)
- Institute of Developmental Biology and Cancer (IBDC) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)
- Centre de génétique - Centre de référence des maladies rares, anomalies du développement et syndromes malformatifs (CHU de Dijon) ; Centre Hospitalier Universitaire de Dijon - Hôpital François Mitterrand (CHU Dijon)
- Maintenance Myélinique et Neuropathies Périphériques (MMNP) ; Institut Génomique, Environnement, Immunité, Santé, Thérapeutique (GEIST) ; Université de Limoges (UNILIM)-Université de Limoges (UNILIM)
- Service de Neurologie [CHU Limoges] ; CHU Limoges
- Service de Pédiatrie médicale [CHU Limoges] ; CHU Limoges
- Centre de reference des maladies neuromusculaires Nantes-Angers, CHU d'Angers et Nantes ; Centre Hospitalier Universitaire d'Angers (CHU Angers) ; PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)-PRES Université Nantes Angers Le Mans (UNAM)
- 87, avenue Raymond-Poincaré, 75116 Paris ; parent
- University Hospital ; University Hospital
- Centre hospitalier universitaire de Poitiers (CHU Poitiers)
- Université de Bordeaux (UB)
- Institut de Myologie ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Association française contre les myopathies (AFM-Téléthon)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
- Centre National de Recherche en Génomique Humaine (CNRGH) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
- Institut de Génomique d'Evry (IG) ; Université Paris-Saclay-Institut de Biologie François JACOB (JACOB) ; Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Direction de Recherche Fondamentale (CEA) (DRF (CEA)) ; Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)-Commissariat à l'énergie atomique et aux énergies alternatives (CEA)
- Infection et inflammation (2I) ; Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines - UFR Sciences de la santé Simone Veil (UVSQ Santé) ; Université de Versailles Saint-Quentin-en-Yvelines (UVSQ)
- Marseille medical genetics - Centre de génétique médicale de Marseille (MMG) ; Aix Marseille Université (AMU)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)
- Département de génétique médicale [Hôpital de la Timone - APHM] ; Aix Marseille Université (AMU)-Assistance Publique - Hôpitaux de Marseille (APHM)- Hôpital de la Timone [CHU - APHM] (TIMONE)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)
- Institut de Recherches Internationales Servier [Suresnes] (IRIS)
- Biochimie et Génétique Moléculaire ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpital Cochin [AP-HP] ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)
Description
La dystrophie musculaire de Becker (BMD) est une pathologie liée à l'X qui se caractérise par une dégénérescence des muscles squelettiques et/ou associée à une cardiomyopathie. Les patients Becker BMDdel45-55 présentent une délétion "en phase" des exons 45 à 55 dans le gène DMD. Les introns 44 et 55 qui bordent cette délétion contiennent des séquences régulatrices comme des long-non-coding ARN (lncRNA). Chaque patient BMDdel45-55 présente un point de cassure différent et donc un neo-intron unique avec potentiellement des modifications dans les séquences de lncRNA.L'objectif du projet est d'établir une caractérisation génomique d'une cohorte unique de patients BMDdel45-55 et d'étudier des facteurs impliqués dans leur variabilité phénotypique.Nous avons réalisé (i)une caractérisation phénotypique chez 49 patients, (ii)un séquençage du génome entier chez 19/49 patients et (iii)une étude des lncRNA chez 38/49 patients. Nous avons établi le profil des lncRNA dans des myoblastes immortalisés des sujets sains et DMD avec une délétion des exons 45-52 (Myo-45-52).L'étude phénotypique de notre population identifie une cardiomyopathie dilatée (22%), des difficultés à la marche/course (46%), la fatigabilité (34%). Dans 51% l'âge d'apparition des premiers signes est <18 ans (inconnu 22%). L'étude de la présence de lncRNA au niveau génomique met en évidence plusieurs clusters. L'absence génomique de certains lncRNA s'associe avec un phénotype clinique modéré. L'étude des mêmes lncRNA dans les myoblastes immortalisés a permis d'identifier deux lncRNA non-exprimés dans les Myo-45-52.Notre travail présente une caractérisation phénotypique et génomique de la plus grande cohorte de patients BMDdel45-55. Nous avons identifié des clusters avec un phénotype clinique modéré en fonction du nombre génomique de lncRNA. La caractérisation génomique des candidats pour la thérapie par saut d'exons 45-55 serait favorable dans le design des futures essais cliniques thérapeutiques.
Abstract
International audienceAdditional details
Identifiers
- URL
- https://hal.science/hal-04015227
- URN
- urn:oai:HAL:hal-04015227v1
Origin repository
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- UNICA