g-INFO portal: a solution to monitor Influenza A on the Grid for non-grid users

Creators: Doan, Trung-Tung; Dao, Quang-Minh; Vu, Trong-Hieu; Pham, Hong-Phong; Breton, Vincent; Nguyen, Hong-Quang; Salzemann, J.; Legre, Yannick; Le, Thanh-Hoa; Montagnat, Johan

Others:: Institut de la francophonie pour l'informatique (IFI) ; Agence universitaire de la francophonie; High Performance Computing Center (HPCC) ; Hanoi University of Science and Technology (HUST); Institute of Information Technology ; Vietnamese Academy of Science and Technology; High Performance Computing Center (HPCC) ; Hanoi University of Science and Technology (HUST); PCSV ; Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand (LPC) ; Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); Laboratoire de Physique Corpusculaire - Clermont-Ferrand (LPC) ; Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-Institut National de Physique Nucléaire et de Physique des Particules du CNRS (IN2P3)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS); HealthGrid ; HealthGrid association (HealthGrid) ; HealthGrid-HealthGrid; Institute of Biotechnology ; Vietnam Academy of Sciences and Technology; Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia-Antipolis (I3S) / Equipe MODALIS ; Scalable and Pervasive softwARe and Knowledge Systems (Laboratoire I3S - SPARKS) ; Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Laboratoire d'Informatique, Signaux, et Systèmes de Sophia Antipolis (I3S) ; Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)-Université Nice Sophia Antipolis (1965 - 2019) (UNS) ; COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Côte d'Azur (UCA)

Description

In this paper, we introduce a portal for monitoring Influenza A on a grid-based system. Influenza A keeps on being a major threat to public health worldwide; especially if one virus can mutate itself so that it acquires the capacity for human to human transmission of H1N1 as well as the high death rate of H5N1. The existing g-INFO (Grid-based Information Network for Flu Observation) project provides a complete system for monitoring flu virus on the Grid. We present here a portal that operates on top of the g-INFO system as a solution for non-grid users to utilize grid services for analyzing molecular biology data of Influenza A.

Abstract

International audience

g-INFO portal: a solution to monitor Influenza A on the Grid for non-grid users

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