COVID-19 patients age, comorbidity profiles and clinical presentation related to the SARS-CoV-2 UK-variant spread in the Southeast of France

Description

Abstract The variant 20I/501Y.V1, associated to a higher risk of transmissibility, emerged in Nice city (Southeast of France, French Riviera) during January 2021. The pandemic has resumed late December 2020 in this area. A high incidence rate together with a fast turn-over of the main circulating variants, provided us the opportunity to analyze modifications in clinical profile and outcome traits. We performed an observational study in the University hospital of Nice from December 2020 to February 2021. We analyzed data of sequencing of SARS-CoV-2 from the sewage collector and PCR screening from all positive samples at the hospital. Then, we described the characteristics of all COVID-19 patients admitted in the emergency department (ED) (n = 1247) and those hospitalized in the infectious diseases ward or ICU (n = 232). The UK-variant was absent in this area in December, then increasingly spread in January representing 59% of the PCR screening performed mid-February. The rate of patients over 65 years admitted to the ED decreased from 63 to 50% (p = 0.001). The mean age of hospitalized patients in the infectious diseases ward decreased from 70.7 to 59.2 (p < 0.001) while the proportion of patients without comorbidity increased from 16 to 42% (p = 0.007). Spread of the UK-variant in the Southeast of France affects younger and healthier patients.

Abstract (French)

Le variant 20I/501Y.V1, associé à un risque de transmissibilité plus élevé, est apparu dans la ville de Nice (Sud-Est de la France, Côte d'Azur) en janvier 2021. La pandémie a repris fin décembre 2020 dans cette région. Un taux d'incidence élevé et une rotation rapide des principaux variants circulants nous ont permis d'analyser les modifications du profil clinique et des résultats. Nous avons réalisé une étude observationnelle au CHU de Nice de décembre 2020 à février 2021. Nous avons analysé en parallèle les données du séquençage du SARS-CoV-2 à partir du collecteur d'eaux usées et du dépistage par PCR de tous les échantillons positifs à l'hôpital. Nous avons ensuite décrit les caractéristiques de tous les patients COVID-19 admis aux urgences (n = 1247) et ceux hospitalisés dans le service des maladies infectieuses (n = 232). Le variant alpha du SARS-CoV2 était absent dans cette région en décembre, puis s'est répandu pendant le mois de janvier 2021, représentant 59% des dépistages par PCR effectués à la mi-février 2021. Le taux de patients de plus de 65 ans admis aux urgences a diminué de 63 à 50 % (p = 0,001). L'âge moyen des patients hospitalisés dans le service des maladies infectieuses a diminué de 70,7 à 59,2 (p < 0,001) tandis que la proportion de patients sans comorbidité a augmenté de 16 à 42 % (p = 0,007). La propagation du variante alpha dans le sud-est de la France touche ainsi des patients plus jeunes et en meilleure santé.

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