Published February 21, 2020 | Version v1
Journal article

Genetic alterations of malignant pleural mesothelioma: association to tumor heterogeneity and overall survival Author names

Others:
Centre de Recherche des Cordeliers (CRC (UMR_S_1138 / U1138)) ; École pratique des hautes études (EPHE) ; Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris Diderot - Paris 7 (UPD7)-Université Paris Descartes - Paris 5 (UPD5)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Sorbonne Université (SU)
(le programme) Cartes d'identité des tumeurs (CIT) ; Ligue Nationales Contre le Cancer (LNCC)
Genexpress, Génomique Fonctionnelle et Biologie Systémique pour la Santé ; Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Institut de Pathologie [CHU Lille] ; Pôle de Biologie Pathologie Génétique [CHU Lille] ; Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)
Université de Lille
Laboratoire de Pathologie Clinique et Expérimentale. Hôpital Pasteur [Nice] ; Hôpital Pasteur [Nice] (CHU)
FHU OncoAge - Pathologies liées à l'âge [CHU Nice] (OncoAge) ; Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire [UNIV Côte d'Azur] (UPMC)-Université Côte d'Azur (UCA)
Service d'Anatomo-cytopathologie [Hôpital Européen Georges Pompidou - APHP] ; Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP) ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)
Service de Chirurgie Thoracique [CHRU Lille] ; Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)
Service de Pneumologie et de Pathologie Professionnelle [CHI Créteil] ; CHI Créteil
Réseau National Expert pour le Mésothéliome Pleural Malin [Lille] (MESOCLIN)
Pneumologie et Oncologie Thoracique [CHRU de Lille] ; PRES Université Lille Nord de France-Centre Hospitalier Régional Universitaire [Lille] (CHRU Lille)-Faculté de Médecine Henri Warembourg - Université de Lille-Hôpital Albert Calmette
Service de Chirurgie Thoracique (Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] HEGP) ; Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP) ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)
Hôpital Européen Georges Pompidou [APHP] (HEGP) ; Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Hôpitaux Universitaires Paris Ouest - Hôpitaux Universitaires Île de France Ouest (HUPO)
This work was supported by Inserm, the Ligue Contre le Cancer (Ile de France committee and national program Cartes d'Identité des Tumeurs (CIT)), the Fondation ARC pour la recherche sur le cancer, Hadassah France, and the Chancellerie des Universités de Paris (Legs POIX). LQ, JBA, FM and JdW were supported by grants from Cancéropôle Région Île-de France, from Fondation pour la Recherche Médicale (FRM), from the Institut thématique multi-organismes (ITMO) Cancer (Plan Cancer 2014-2019) and from the Fondation ARC, respectively. JdW and FM were also supported by grant of the Société Française de Chirurgie Thoracique et Cardio-Vasculaire (SFCTCV). The Inserm research unit is supported by the Labex OncoImmunology (investissement d'avenir), Coup d'Elan de la Fondation Bettencourt-Shueller, the SIRIC CARPEM, the Institut thématique multi-organismes (ITMO) Cancer (Plan Cancer 2014-2019) and Cancéropôle Île-de-France.

Description

Development of precision medicine for malignant pleural mesothelioma (MPM) requires a deep knowledge of tumor heterogeneity. Histologic and molecular classifications and histo-molecular gradients have been proposed to describe heterogeneity, but a deeper understanding of gene mutations in the context of MPM heterogeneity is required and the associations between mutations and clinical data need to be refined. We characterized genetic alterations on one of the largest MPM series (266 tumor samples), well-annotated with histologic, molecular and clinical data of patients. Targeted next generation sequencing was performed focusing on the major MPM mutated genes and the TERT promoter. Molecular heterogeneity was characterized using predictors allowing classification of each tumor into the previously described molecular subtypes and the determination of the proportion of epithelioïd-like and sarcomatoïd-like components (E/S.scores). The mutation frequencies are consistent with literature data, but this study emphasized that TERT promoter, not considered by previous large sequencing studies, was the third locus most affected by mutations in MPM. Mutations in TERT promoter, NF2 and LATS2 were more frequent in non-epithelioid MPM and positively associated to the S.score. BAP1, NF2, TERT promoter, TP53 and SETD2 mutations were enriched in some molecular subtypes. NF2 mutation rate was higher in asbestos unexposed patient. TERT promoter, NF2 and TP53 mutations were associated with a poorer overall survival. Our findings lead to a better characterization of MPM heterogeneity by identifying new significant associations between mutational status and histologic and molecular heterogeneity. Strikingly, we highlight the strong association between new mutations and overall survival.

Abstract

International audience

Additional details

Created:
December 4, 2022
Modified:
November 29, 2023