Stratégie de résistance durable aux nématodes à galles chez les porte-greffe de [i]Prunus[/i] par pyramidage : marquage à haute résolution d'un gène du pêcher et localisation fine d'un gène de l'amandier

Description

Les nématodes à galles ([i]Meloidogyne[/i] spp.) sont de ravageurs extrêmement polyphages des racines et dont l'impact est très important à l'échelle globale. La stratégie de résistance aux espèces prédominantes [i]M. arenaria[/i], [i]M. incognita[/i] et[i] M. javanica[/i], est une alternative prioritaire chez de nombreuses plantes cultivées confrontées au retrait des nématicides et notamment chez les arbres fruitiers du genre Prunus. Trois gènes majeurs dominants de résistance, Ma (prunier), RMia (pêcher) et RMja (amandier), ont été identifiés et cartographiés dans cet objectif. Le pyramidagede ces trois gènes, par exemple dans des hybrides 3-voies, ouvre la voie à la création de porte-greffe protégés par au moins deux gènes vis-à-vis de chacune des espèces de nématodes précitées. Du fait de l'interaction durable entre ces plantes pérenneset les nématodes, ce pyramidagegarantit la création de matériels dotés d'une durabilité de résistance sans précédent au niveau mondial. La sélection assistée par marqueurs (SAM) du gène Ma,à spectre complet et cloné (famille desTIR-NB-LRRs(TNLs)), est possible grâce à des marqueurs SCAR intragéniques chez la source P.2175. Nous présentons donc ici les résultats des travaux sur les gènes RMia et RMja conduits dans le cadre d'un projet soutenu par le Ministère de l'Agriculture. Une cartographie à haute résolution du gène RMia chez la source Nemared, par marqueurs SSR (simple sequence repeat) et SNP (single nucleotide polymorphism), a été entreprise notamment dans une descendance F2 [Montclar (sensible) x Nemared]. Des marqueurs SNP ont permis de localiser le gène dans un intervalle physique de 92 kb du génome de référence du pêcher Lovell contenant 3 gènes candidats de type TNL. Le gène RMja porté par l'amandier Alnem, dont le marquage fin est en cours à partir de 800 individus de la population F2 [Lauranne (sensible) x Alnem]), a été situé dans un intervalle d'environ 2 Mb contenant également l'orthologue de Ma. L'obtention prochaine de la séquence NGS des parents Lauranne et Alnem permettra d'assurer un marquage à haute résolution de RMja et ainsi de disposer des outils de SAM pour les trois gènes de résistance

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