NOWAK , Virginie

Last name: NOWAK

First name: Virginie

June 6, 2012 (v1)

Conference paper

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Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Terrat, Sébastien Plassart, Pierre Christen, Richard

La diversité microbienne d'un sol (que l'on estime à 100000 à 1000000 d'espè ces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Toutefois, d'importantes avancé es en biologie moléculaire (comme le développement du pyrosé quençage), ont permis d'obtenir plusieurs centaines de milliers de sé quences à partir d'un ADN...

Uploaded on: December 4, 2022
April 23, 2012 (v1)

Publication

Metadata-only

Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Terrat, Sébastien Plassart, Pierre Christen, Richard

La diversité microbienne d'un sol (que l'on estime à 100000 à 1000000 d'espè ces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Toutefois, d'importantes avancé es en biologie moléculaire (comme le développement du pyrosé quençage), ont permis d'obtenir plusieurs centaines de milliers de sé quences à partir d'un ADN...

Uploaded on: March 25, 2023
November 14, 2011 (v1)

Publication

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Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Terrat, Sébastien Plassart, Pierre Christen, R.

La diversité microbienne d'un sol (que l'on estime entre 100 000 et 1 000 000 d'espèces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Toutefois, d'importantes avancées en biologie moléculaire, comme le développement du pyroséquençage, ont permis d'obtenir plusieurs centaines de milliers de séquences à partir d'un ADN...

Uploaded on: February 22, 2023
November 28, 2011 (v1)

Publication

Metadata-only

Optimisation du pyroséquençage haut-débit pour caractériser la diversité taxonomique des communautés bactériennes des sols

Terrat, Sébastien Plassart, Pierre Christen, R.

La diversité microbienne d'un sol (que l'on estime entre 100 000 et 1 000 000 d'espèces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Toutefois, d'importantes avancées en biologie moléculaire, comme le développement du pyroséquençage, ont permis d'obtenir plusieurs centaines de milliers de séquences à partir d'un ADN...

Uploaded on: December 4, 2022
January 31, 2012 (v1)

Conference paper

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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité des communautés microbiennes du sol : nécessité d'un 'pipeline' bio-informatique pour les biologistes

Terrat, Sébastien Dequiedt, Samuel Christen, Richard

National audience

Uploaded on: December 4, 2022
April 23, 2012 (v1)

Conference paper

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Apport des nouvelles générations de séquençage pour accéder à la diversité et la richesse des communautés microbiennes de sols issus d'échantillonnage de grande ampleur

Terrat, Sébastien Dequiedt, Samuel Christen, Richard

La diversité microbienne d'un sol (que l'on estime entre 105 et 106 espèces différentes par gramme de sol) est difficile à caractériser. Cependant, les techniques de séquençage haut-débit comme le pyroséquençage permettent maintenant d'étudier la diversité des communautés microbiennes du sol en se basant sur un marqueur...

Uploaded on: December 4, 2022
January 2012 (v1)

Journal article

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Molecular biomass and MetaTaxogenomic assessment of soil microbial communities as influenced by soil DNA extraction procedure

Terrat, Sebastien Christen, Richard Dequiedt, Samuel

Three soil DNA extraction procedures (homemade protocols and commercial kit) varying in their practicability were applied to contrasting soils to evaluate their efficiency in recovering: (i) soil DNA and (ii) bacterial diversity estimated by 16S rDNA pyrosequencing. Significant differences in DNA yield were systematically observed between...

Uploaded on: February 28, 2023

NOWAK , Virginie

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